Вівторок, 31 грудня 2013. - Вчені вперше почали поєднувати обчислювальну та геномну інформацію для прогнозування нових застосувань існуючих ліків. Комп'ютерне дослідження, що фінансується Національним інститутом охорони здоров'я (NIH), проаналізувало геномні дані та фармакологічні дані для прогнозування нових вживаних препаратів, які вже є на ринку. Дослідники під керівництвом доктора Атула Дж. Бутте зі Стенфордського університету в Каліфорнії повідомили про свої результати у двох статтях в останньому випуску «Science Translational Medicine». "Вивезення нового препарату на ринок зазвичай коштує близько мільярда доларів і багато років досліджень та розробок", - каже доктор Рошель М. Лонг, директор мережі досліджень фармакогеноміки NIH, "якщо ми можемо знайти способи повторного використання препаратів, які вже затверджені існуючі методи лікування можуть бути покращені, а також заощаджено час та гроші ".
Вчені дістали свої дані з омнібуса експресії генів (з Національного центру інформації про біотехнології), публічної бази даних, що містить результати тисяч геномних досліджень, у широкому діапазоні галузей, представлених дослідниками з усього світу.
Група Бутте зосередилась на 100 захворюваннях та 164 лікарських препаратах, створивши комп'ютерну програму для пошуку тисяч можливих комбінацій лікарських засобів, ліків та хвороб, чиї форми експресії генів скасовують один одного. Наприклад, якщо захворювання підвищує активність певних генів, програма намагається співставити його з одним або декількома препаратами, які знижують цю активність.
Багато комбінацій лікарських засобів відомі та знаходяться в клінічному застосуванні, що підтверджує обгрунтованість цього підходу. Наприклад, аналіз правильно передбачив, що преднізолон може лікувати хворобу Крона - захворювання, для якого цей препарат є стандартною терапією.
Інші комбінації були новими та дивними: препарат для лікування виразок (циметидин) збіг з раком легенів, а протисудомний засіб (топірамат) співпав із запальною хворобою кишечника - яка включає хворобу Крона.
Щоб підтвердити зв’язок циметидину з раком легенів, команда випробувала цей препарат на клітинах раку легенів людини в лабораторії та на клітинах, імплантованих мишами. В обох випадках препарат уповільнював ріст ракових клітин порівняно з контрольною групою (клітини або миші), які не отримували циметидин.
Щоб перевірити, чи впливає протисудомний топірамат на запальні захворювання кишечника, дослідники призначили препарат щурам, у яких були симптоми такого захворювання кишечника: діарея, запалення, виразки та мікроскопічне ураження товстої кишки. Препарат зменшив усі ці симптоми, іноді навіть краще, ніж преднізолон.
Крім того, вчені зазначили, що захворювання з подібними молекулярними процесами (наприклад, ті, що впливають на імунну систему) були згруповані в аналізі. Так само робили препарати з подібною дією (наприклад, ті, що сповільнюють ділення клітин). Дослідники вважають, що, вивчаючи членів цих несподіваних угруповань, вони могли більше дізнатися про прогрес певних захворювань та про функціонування деяких лікарських засобів на молекулярному рівні.
За словами Лонга, "це дослідження ще на ранній стадії, але це перспективний метод для творчого, швидкого та доступного підходу, коли справа стосується виявлення нових застосувань для лікарських засобів, які ми вже маємо в терапевтичному арсеналі".
Джерело:
Теги:
Перевіряти Сім'я Краса
Вчені дістали свої дані з омнібуса експресії генів (з Національного центру інформації про біотехнології), публічної бази даних, що містить результати тисяч геномних досліджень, у широкому діапазоні галузей, представлених дослідниками з усього світу.
Група Бутте зосередилась на 100 захворюваннях та 164 лікарських препаратах, створивши комп'ютерну програму для пошуку тисяч можливих комбінацій лікарських засобів, ліків та хвороб, чиї форми експресії генів скасовують один одного. Наприклад, якщо захворювання підвищує активність певних генів, програма намагається співставити його з одним або декількома препаратами, які знижують цю активність.
Багато комбінацій лікарських засобів відомі та знаходяться в клінічному застосуванні, що підтверджує обгрунтованість цього підходу. Наприклад, аналіз правильно передбачив, що преднізолон може лікувати хворобу Крона - захворювання, для якого цей препарат є стандартною терапією.
Інші комбінації були новими та дивними: препарат для лікування виразок (циметидин) збіг з раком легенів, а протисудомний засіб (топірамат) співпав із запальною хворобою кишечника - яка включає хворобу Крона.
Щоб підтвердити зв’язок циметидину з раком легенів, команда випробувала цей препарат на клітинах раку легенів людини в лабораторії та на клітинах, імплантованих мишами. В обох випадках препарат уповільнював ріст ракових клітин порівняно з контрольною групою (клітини або миші), які не отримували циметидин.
Щоб перевірити, чи впливає протисудомний топірамат на запальні захворювання кишечника, дослідники призначили препарат щурам, у яких були симптоми такого захворювання кишечника: діарея, запалення, виразки та мікроскопічне ураження товстої кишки. Препарат зменшив усі ці симптоми, іноді навіть краще, ніж преднізолон.
Крім того, вчені зазначили, що захворювання з подібними молекулярними процесами (наприклад, ті, що впливають на імунну систему) були згруповані в аналізі. Так само робили препарати з подібною дією (наприклад, ті, що сповільнюють ділення клітин). Дослідники вважають, що, вивчаючи членів цих несподіваних угруповань, вони могли більше дізнатися про прогрес певних захворювань та про функціонування деяких лікарських засобів на молекулярному рівні.
За словами Лонга, "це дослідження ще на ранній стадії, але це перспективний метод для творчого, швидкого та доступного підходу, коли справа стосується виявлення нових застосувань для лікарських засобів, які ми вже маємо в терапевтичному арсеналі".
Джерело:
